東城區(qū)科技委員會（區(qū)知識產權局）下設三個主要部門，辦公室、科學技術管理科以及專利管理科，以支撐其各項職責的履行。
辦公室作為核心政務部門，負責處理機關日常政務事務，包括公文處理、電子政務、會務組織等。它還負責科普及科技合作規(guī)劃的制定，協(xié)調區(qū)域內的科學普及活動。
科學技術管理科專注于本區(qū)科技創(chuàng)新體系的建設與實施相關政策，以促進科技發(fā)展和扶持科技企業(yè)的發(fā)展。該部門還負責管理科技項目經費和高新技術企業(yè)的管理服務，以及技術合同認定登記和技術市場管理工作。
專利管理科的核心職責是執(zhí)行國家和北京市的知識產權法律法規(guī)，統(tǒng)籌協(xié)調本區(qū)的知識產權工作，推進知識產權保護機制建設。還包括專利執(zhí)法、專利試點、北京市發(fā)明專利獎的組織推薦等工作。
北京市東城區(qū)國家稅務局亦設有多個關鍵部門，各自負責稅務領域的不同方面。其中，辦公室作為稅務局的核心管理部門，負責年度工作計劃制定、文書檔案管理等重要事務。政策法規(guī)科專注于稅收政策的制定與執(zhí)行監(jiān)督，確保稅收法律的正確實施。
貨物和勞務稅科與所得稅科分別專注于增值稅、消費稅、營業(yè)稅和企業(yè)所得稅等稅種的征收管理。這些部門制定了詳細的征收管理實施辦法，并通過納稅評估、稅源管理等手段監(jiān)控稅源。
收入核算科負責稅收收入的計劃編制、監(jiān)督檢查以及分析預測等工作。財務管理科則負責年度預算的編制、稅收成本分析以及內部控制制度的建立。人事科則承擔干部人事管理的執(zhí)行工作，包括干部任免、人員調配等。教育科負責制定教育培訓計劃并確保培訓質量。監(jiān)察室則負責紀律檢查與行政監(jiān)察工作，維護黨風廉政。大企業(yè)和國際稅務管理科負責對大型企業(yè)的納稅服務與稅源管理，并承擔國際稅收情報交換的工作。進出口稅收管理科則負責進出口貿易稅收管理工作，防范和打擊騙取出口退稅行為。機關黨委辦公室和離退休干部科分別負責黨群工作和離退休干部的服務與管理。
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